El Plan de Manejo Ambiental es auditado cada dos años por técnicos calificados externos a la empresa, y es revisado y aprobado por el MAAE. Parte del cumplimiento del mismo, radica en la realización de mediciones de las variables ambientales: Ruido, emisiones atmosféricas y descargas de agua. Estas mediciones se realizan de manera semestral por parte de un laboratorio debidamente certificado y acreditado por el SAE, cuyos resultados se entregan al MAAE, quien finalmente emite un documento de aprobación de dichas mediciones. Como medida de contingencia se cuenta con dos Trampas de Grasas y un Cubeto anti derrames de diesel que previenen la contaminación de los suelos y vertientes naturales.

Como en toda labor productiva, se generan, a parte del producto terminado, algunos desechos que deben ser tratados previo a su regreso al ambiente circundante. En el caso del agua, Arboriente ha construido una Planta de tratamiento de aguas residuales PTAR, en la cual se filtran las impurezas y se obtiene agua con características dentro de los parámetros permitidos para ser descargadas en esteros o el sistema de alcantarillado.

De la misma manera que con la PTAR, para el tratamiento de las emisiones atmosféricas provenientes de la combustión de biomasa en el caldero de biomasa, la empresa ha instalado un sistema de retención de partículas de ceniza, que evita que estas se dirijan a la atmósfera, además la ceniza recogida sirve para abonar los suelos. En el mismo sentido, se han realizado grandes esfuerzos en aislamiento acústico para controlar las emisiones de ruido hacia el espacio circundante a la empresa.